Physicien devenu économiste, Claude Henry a travaillé à l'École Polytechnique pendant plus de trente ans, comme professeur et comme directeur du laboratoire d'économétrie. Pendant cette période, il a été co-éditeur de la Review of Economic Studies puis du Journal of Public Economics. Ses publications portent sur : interactions faibles entre particules élémentaires ; équations différentielles avec discontinuités ; valeurs d'option et effet d'irréversibilité ; les décisions en incertitude ; l'économie des services publics et régulation ; la propriété intellectuelle et innovation. Il a aussi été, de 1997 à 2002, membre du Conseil d'analyse économique, sous l'autorité du Premier ministre Lionel Jospin.

Claude Henry est aujourd'hui professeur de développement durable à Sciences Po Paris et à l’Université Columbia (New York, États-Unis). Il est membre de l'Academia Europea, Fellow de l'Econometric Society, et médaille d’argent du CNRS.