Historien de formation, diplômé de Sciences Po, Michel Gardette a accompli toute sa carrière au sein de cette institution. D’abord, pendant une dizaine d’années, comme responsable de cycles de formation (en charge de la « section Communication et ressources humaines », niveau master), puis en tant qu’adjoint du directeur scientifique (de 2000 à 2004 et de 2008 à 2013) et, enfin, comme directeur de la bibliothèque de Sciences Po (de 2004 à 2008).

Depuis 2013, il est directeur délégué de Sciences Po et exerce, pour l’essentiel, des fonctions de conseiller auprès du directeur de Sciences Po et du président de la Fondation nationale des sciences politiques.