Hubert de Milly est ingénieur agronome et docteur en économie institutionnelle. 
A l’AFD depuis 2013, il suit l’agenda de l’aide internationale, et notamment la question des Objectifs de développement durable (ODD), au sein de la Direction de la Stratégie. Il a aussi participé à la réforme des modes de comptabilisation de l’Aide publique au développement à l’OCDE.
Auparavant, après une vingtaine d’année de terrain en Afrique et en Inde pour les ministères français de la Coopération et des Affaires Etrangères, il a été sous-directeur adjoint des Stratégies de développement au MAE de 2004 à 2007. Il a travaillé de 2007 à 2012 à l’OCDE sur les questions d’efficacité de l’aide, assurant notamment le secrétariat de la Déclaration de Paris et contribuant à l’organisation des forums d’Accra (2008) et de Busan (2011).